Manfred Cordes (* 1953) ist ein deutscher Musiker. Er ist Professor für Musiktheorie, Kontrapunkt, Ensemble und seit Mai 2007 Rektor der Hochschule für Künste Bremen.
Cordes ist Spezialist für die Musik des 16. und frühen 17. Jahrhunderts. Ausgebildet als Schul- und Kirchenmusiker, Sänger und Altphilologe, wurde er promoviert mit einer Arbeit über Die Tonarten- und Affektenlehre der Renaissance. Als Leiter des 1993 gegründeten Ensembles Weser-Renaissance Bremen entwarf und leitete er eine Vielzahl von Konzertprogrammen, die sowohl in Deutschlands wie auf internationalen Festivals große Beachtung fanden.